Este linaje es levantino, concretamente de Valencia, ya que tuvo su origen en el lugar de Hoyos.
Ahora bien, el apellido muy pronto se fue extendiendo por otros puntos de la península,con preferencia en la Merindad de Trasmiera y en el valle de Penagos.
Se conserva testimonio de que muy pronto pasaron a las Indias, pudiendo encontrarse a varios de este apellido, concretamente a don Diego de Hoyos y don Manuel de Hoyos, entre aquellos que acompañaron a Hernán Cortés en las campañas de la conquista de Méjico.
El primero encontró gloriosa muerte en la batalla de Otumba y el segundo se estableció en la capital mejicana, dando origen a la familia Hoyos en aquella nación.

Armas: Escudo de azur, banda de plata con dragantes de oro linguados de gules, bordura de plata y ocho armiños.

Origen: Castellano. Del lugar de su nombre en el concejo de Valdecolea, partido judicial de Reinosa (Santander). Algunos autores lo situan en Valencia, en el lugar de Hoyos. Una rama pasó a América.Don Diego de Hoyos y don Manuel de Hoyos acompañaron a Hernán Cortés en la conquista de Méjico.Descripción del Escudo de Armas: En campo de azur, una banda de plata engolada en cabezas de dragones de oro lampasados de gules. Bordura de plata, con ocho armiños de sable.