Escrito en vasco, procede de navarra y es de origen euscaro, en donde hay un lugar llamado con este apellido pero no esta esclarecido si el sitio es anterior al apellido.

El apellido Góngora (escrito en vasco Gongora) es un apellido éuscaro y toponímico proveniente de la familia real Navarra, donde hay un pueblo con el mismo nombre. Se estima que un Góngora luchó en la batalla de las Navas de Tolosa contra los árabes.

Proviene de las palabras vascas Goien+Gora, el apellido original es Gongora sin acentuación, y se pronuncia tal y como se lee, sin hacer fuerza en la sílaba -gon. Su adaptación al español es poniéndole tilde en la primera O, y haciendo fuerza en la sílaba -gon. Su adaptación al español de forma escrita es Góngora.

Historia
Buena parte de los Góngora emigró a tierras andaluzas, lugar donde nacería el ilustre poeta del barroco, Don Luis de Góngora y Argote, hacia 1561.

Otra rama pasó a Chile y formó parte de la Real Compañía de Guardias Marinas (1751), y en el Real Tribunal de Navarra en 1558, 1566, 1665 y 1691. Carlos II concedió el título nobiliario de Marqués de Góngora el 7 de marzo de 1695, a Juan Cruzat y Góngora.

Hacia fines del siglo XIX y comienzos del XX, una gran parte de la familia Góngora se embarcó rumbo a América, siendo sus principales destinos Argentina, Chile, Colombia, Cuba, Ecuador, México, Brasil y Uruguay.

Actualmente es un apellido muy poco difundido en el mundo hispano, si bien cuenta con presencia en la mayor parte de Latinoamérica y España. Asimismo, la enorme mayoría de los Góngora comparte ascendencia andaluza, principalmente de las provincias de Almería y Córdoba.

Otro detalle a tener en cuenta es el uso de la preposición De que solía ir delante del apellido y que más tarde se suprimiría, ya sea por factores sociales o cuestiones de inmigración. Por este motivo no debe extrañar que antiguas generaciones de los Góngora portaran en su acta de nacimiento o documento parroquial la forma "De" en nombres como Luis de Góngora, entre otros.