Muy antiguo apellido castellano de origen toponímico, relativamente frecuente y repartido por España, originario de la villa de Ayllón (Segovia). El étimo del topónimo Ayllón podría ser, según Faure, el árabe “ayûn, “fuentes”, aunque según Emilio Nieto, podría tratarse de un derivado romance del latín agellu, “campito, campillo”, a través de un resultado ayillo o ayiello = Ayillón (con aumentativo) = Ayllón. Sus ramas se extendieron por dicha provincia de Segovia y por otras castellanas, pasando posteriormente a Andalucía y otras regiones, así como a Hispanoamérica.

Fernán Ruiz Ayllón, juntamente con Ruy Muñoz Ayllón y Martín Muñoz Ayllón se encontraban entre los 50 caballeros de linaje escogidos entre los 200 que el Rey Alfonso X heredó en Sevilla para poblar Arcos de la Frontera (Cádiz), después de su conquista a los moros, recibiendo casas y heredades. Ante la Real Chancillería de Valladolid probaron su hidalguía, entre otros, Diego, Francisco y Pedro de Ayllón, en 1529, 1561 y 1527, respectivamente. Ante la Real Chancillería de Granada hicieron la misma probanza de hidalguía, entre otros de este apellido: Alonso de Ayllón, vecino de Huete (Cuenca), en 1557; Pedro Ayllón, vecino de Jérez, en 1543, y José Ayllón de los Ríos Hurtado de Mendoza, vecino de Marchena (Sevilla), en 1800.

Armas.- “Repertorio de Blasones de la Comunidad Hispánica”, tomo letras A-CH, recoge, en primer lugar, para Ayllón: En sinople, tres cruces pometeadas de oro.

Apellido procedente del germánico Ermemir, compuesto de Ermin, nombre de un semi-dios, y de mir, ilustre. Uno de los ataques a las costas tarraconenses por los piratas sarracenos fue dirigido por Arnant Aymamir, en el puerto de Salou con 20 galeras reales moras el 16 de octubre de 1590