Este apellido es original de Calabria y llegó a España hace siglos como Santa Eufemia, luego pasó a ser Santofimia y en América llego como Santofimio.

Santofimio es un apellido de origen italiano. De raíz toponímica parece surgir de un municipio con el nombre de Sant´Eufemia (Santa Eufemia). Probablemente Sant´Eufemia d´Aspromonte en Reggio Calabria o Sant´Eufemia de Maiella en Abruzzos. En Italia el apellido existe como Santafemia/Santeufemia y a España llegó como Santofimia para luego convertirse en Santofimio al llegar a América.

Según el historiador español Enrique Soria Mesa, el apellido Santofimia (del cual derivó Santofimio) era conocido en el Reino español de Granada (Andalucía) por ser perteneciente a una familia "judaizante", es decir: que practicaba el judaísmo en secreto tras haber sido convertida al catolicismo bajo amenaza de la inquisición.

En su libro "LOS ESTATUTOS MUNICIPALES DE LIMPIEZA DE SANGRE EN LA CASTILLA MODERNA. UNA REVISIÓN CRÍTICA", Soria Mesa nos dice: "Los Santofimia fueron el linaje judeoconverso más conocido de todo el Reino de Granada, tristemente notorio por ver cómo decenas de sus miembros, sobre todo mujeres, desfilaron ante la vergüenza pública en el famoso Auto de Fe de 1593 y su continuación de 1595. Muriendo en la hoguera unos cuantos de ellos, los más recalcitrantes a los ojos de los inquisidores36. Auténtico clan por lo prolífico, en realidad los Santofimia compusieron una extensísima parentela compuesta de diversas familias estrechamente emparentadas entre sí, enlazadas una y otra vez mediante el recurso a una endogamia recurrente".